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H7N9病毒来源找到啦~是个中韩混血儿
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发表于:2013-04-10 14:59
H7N9病毒来源找到啦~是个中韩混血儿
自3月31日人感染H7N9禽流感病毒疫情以来,这个领域的专家都在寻找这个病毒的来源。
昨天,中科院病原微生物与免疫学重点实验室研究人员说,人感染H7N9病毒是个重配病毒,它的基因重配发生地很有可能在长三角地区。过程可能经由韩国野鸟在自然迁徙过程中,和长三角地区的鸭群、鸡群自身带有的禽流感病毒,进行基因重配产生。
H7N9病毒8个基因片断中
2个来自韩国野鸟,另6个来自长三角鸡群
中科院对H7N9病毒基因片段重配的研究结果为:
H7N9病毒的8个基因片段中,H7片段源于浙江鸭群中分离的禽流感病毒,而浙江鸭群中的病毒往上追溯,与韩国野鸟中分离的禽流感病毒同源;
N9片段与韩国野鸟中分离的禽流感病毒同源;
其余6个基因片段源于H9N2禽流感病毒。据病毒基因组比对和亲缘分析显示,这个H9N2禽流感病毒来源于上海、浙江、江苏等长三角地区的鸡群。
韩国来往我国长三角地区的候鸟
以大雁和野鸭等水鸟为主
中科院认为,这次发现的新H7N9禽流感病毒,在自然界的流传过程很可能遵循下列路径:携带H亚型(包括H7N3和H7N9亚型禽流感病毒)的韩国野鸟,迁徙至中国长三角地区,接触浙江鸭群,病毒产生重配,使浙江鸭群携带了H7亚型病毒。鸭群很可能作为一个中间宿主,和浙江、上海等地携带H9N2禽流感病毒的鸡群接触,最终基因重配成为新型禽流感病毒H7N9。
对于韩国野鸟迁徙的情况,浙江省自然博物馆副馆长、鸟类学专家陈水华说,韩国和长三角地区确实有候鸟来往,以水鸟为主,包括雁鸭类(大雁和野鸭)、鸻鹬类等。这些鸟类迁徙能力很强,可以轻易飞越海洋。
新H7N9病毒基因重组地点
可能在江浙一带
南方科技大学生物系副教授贺建奎,在博客上也介绍了他的团队对这个新H7N9病毒基因序列比对的过程,他的研究结果与中科院昨天公布的研究结果基本相同。
贺建奎说,杭州疾控中心和世卫组织中国流感中心,共采集分析了4个新H7N9甲型禽流感的基因组,并在全球流感自发禽流感共享数据库上公布。他的团队用这4个基因组,以及1193个已知的流感各亚型的基因组,做了一个全面的系统生成树和进化分析。
结果表明,在新H7N9甲型禽流感的8个基因片段中,表面血凝素蛋白基因来自于H7亚型病毒,神经氨酸酶基因来自N9家族禽流感,其余6个内核基因都来自H9N2。
贺建奎通过序列比对等也发现,与新H7N9禽流感病毒最接近的病毒多为江浙地区的家禽和野禽,这和此次人感染的地点重合。尤其是H9N2禽流感病毒在东亚地区已经传播多年。因此推测本次基因重组的地点可能在江浙一带。
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发表于:2013-04-10 15:00
这里面也有杭州市疾控中心的辛苦付出
杭州第一例H7N9患者体内的病毒基因序列
已传入全球最大基因库 供全世界科学家共享
现在虽然是候鸟迁徙季节,但目前的禽流感是否与候鸟有关,还没有直接的证据。从韩国鸟类中检出的病毒与H7N9病毒具有一定的同源性,只是间接说明了这次的禽流感与候鸟存在一定的关系,但具体哪类候鸟,以及它们在其中到底起了什么作用,还有待进一步的研究和更多证据。
那么,科研人员是怎么寻找这个新H7N9基因片断来源的?
杭州市疾控中心微生物检验科副科长濮小英说,研究H7N9病毒,有两个数据库可以全球共享,一个是全球公共序列数据库,另一个是全球流感自发禽流感共享数据库。所有人类和禽类测出来的病毒基因序列,都会上传到这两个库里,供全球科学界人士分析。
濮小英说,像杭州第一例人感染H7N9禽流感病例体内的病毒基因序列,已经分析出来,并已上传到这两个库里。分析一个病毒的基因序列差不多要一个多星期,目前第二例患者的病毒基因序列还在分析,还没入库。
“甲型流感病毒都由8个基因片段组成,包括HA、NA、PB2、PB1、PA、NP、MP、NS。病毒的命名由HA、NA这两种基因名称确定。研究这个病毒,肯定要对全部基因片段进行检测,但常规以HA和NA为主要检测对象。”
濮小英分析,中科院的这个最新研究,可能是通过生物软件,对已经上传入库的H7N9确诊患者的病毒基因序列进行了比对,推测基因的相似性。并根据基因序列相似性程度,推测是否同源。
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发表于:2013-04-10 15:02
这世道…………时隔十年后H7N9
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原来如此啊啊
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